L'ambiance est mise d'avantage en lumière par les riches couleurs des vitraux. La plupart de ces remarquables vitraux avaient été originellement installés dans l'église Wesley. Ils furent dessinés par W. J. Fischer et réalisés entre 1902 et 1913 à la Leonard factory ici même dans le Vieux Québec, sur la rue Cook.
Il était fréquent que les vitraux soient offerts par des familles riches en mémoire de leurs chers disparus.
